Activision предоставила слово Джеймсу Хеллеру, главному герою экшена Prototype 2. Основной мишенью Хеллера в новой игре станет Алекс Мерсер, протагонист первой части серии. Именно его, как переносчика вируса Blacklight, Хеллер считает виновным в гибели своей семьи.
Сиквел выйдет в 2012 году на PC, Xbox 360 и PlayStation 3.